imbg | Чей секвенатор лучше?

Британские ученые провели сравнительное исследование трех моделей современных секвенаторов на вирулентном штамме E. coli, ставшим причиной смерти более 40 человек в Германии прошлым летом.

В соревновании участвовали 454 GS Junior (Roche), MiSeq (Illumina) и Ion Torrent Personal Genome Machine (PGM, Life Technologies).

Как и ожидалось, ни одна компания не предлагает универсального решения на сегодня: PGM обладает наибольшей производительностью в час, MiSeq показал наибольшую производительность за запуск и наивысшую точность прочтения, Junior способен генерировать наиболее длинные фрагменты.

При этом у PGM и MiSeq наблюдаются проблемы в точности прочтения длинных мононуклеотидны фрагментов. Данное исследование крайне востребованно потребителями, поскольку агрессивная рекламная политика производителей секвенаторов не позволяет рационально оценить достоинства и проблемы их аппаратов по сравнению с конкурентами.

Биомолекула. Телетайп