imbg: (Default)
 Цитата из статьи , специально для phagolov:

For decades, patients behind the Iron Curtain were denied access to some of the best antibiotics developed in the West. To make do, the Soviet Union invested heavily in the use of bacteriophages — viruses that kill bacteria — to treat infections. Phage therapy is still widely used in Russia, Georgia and Poland, but never took off elsewhere. 



Я не пойму - у нас действительно со времен Хрущева и до сих пор врачи прописывают фаготерапию? Где?

Статья целиком - "Phage therapy gets revitalized"
imbg: (Default)
 Новые козни Госдепа:



С помощью уникальной программы финансирования перспективных разработок в области изучения генома человека правительству США практически удалось достичь долгожданной цели: снизить стоимость секвенирования генома до 1000 $.

Читать целиком: "1000$ за геном"
imbg: (Default)
 Человечество потихоньку учится убивать вирусы, разрабатывая адресные и универсальные стратегии их уничтожения, развивая систему вакцинации и совершенствуя мониторинг распространения новых штаммов. Благодаря методам сравнительной геномики можно очень точно восстановить картину вспышек, а комбинированная терапия позволяет эффективно бороться даже с вирусами, которые быстро эволюционируют прямо в организме пациента.



Однако проблем на пути к усмирению паразитических молекулярных машин всё еще очень много. При этом новые вызовы могут появиться с самых неожиданных сторон. Новые или хорошо забытые старые вирусы могут скрываться в довольно нетривиальных местах — например, в старых могилах или в вечной мерзлоте.


Читать целиком: "Вирусы из могил"
imbg: (Default)
Иногда говорят, что мы видим не глазами, а мозгом, имея в виду, что распознавание объектов происходит в мозгу, в который поступает только «сырая» информация о распределении световых пятен в пространстве. Строго говоря, это не совсем верно. Некоторые этапы обработки происходят уже на уровне сетчатки.



Еще 50 лет назад эксперименты показали, что сетчатка может определить, в какую сторону и с какой скоростью движется зрительный сигнал. Но как именно нейроны сетчатки определяют такую информацию, до недавнего времени оставалось загадкой.

Читать полностью: "Как сетчатка распознаёт движение"
imbg: (Default)
При упоминании флуоресцентных белков люди чаще всего представляют себе разноцветные клетки, забавные рисунки бактериями на чашках Петри, в крайнем случае, целые флуоресцирующие организмы — от медуз до кошек, — эдакая цветная палитра. Однако область применения этого замечательного инструмента расширяется с каждым годом, — как и разнообразие самих белков. В этой статье мы поговорим о новых поколениях флуоресцентных белков и рассмотрим некоторые интересные методы на их основе.


  

Наконец можно почитать статью о флуоресцентных белках, где нет ни слова об надоевшем уже GFP...

Читать целиком: "Флуоресцентные белки: разнообразнее, чем вы думали!"
imbg: (Default)
Один из самых многообещающих  антиоксидантов - резвератол (компонент,  в частности, красного вина) недавно был признан не влияющим на частоту воспалений и продолжительность жизни (выборка 783 человека)... А так хотелось!



В общем, теперь нет научного оправдания пить красное вино каждый день - эти ученые лезут со своими анализами, куда не просят...

Resveratrol Levels and All-Cause Mortality in Older Community-Dwelling Adults
imbg: (Default)
Знаете ли в, что:
 
В отличие от других кровососущих насекомых, не только самки, но и самцы мухи цеце (Glossina) питаются исключительно кровью млекопитающих.

Если обычные мухи откладывают десятки и сотни яиц, то самки Glossina рожают одну крупную личинку, готовую к окукливанию. За свою долгую (по мушиным меркам) жизнь самка может успеть родить до 8–10 личинок; каждая беременность длится около 10 дней.

Развиваясь в материнском организме, личинка питается молоком, которое вырабатывается в специальных молочных железах. Они развились в ходе эволюции из придаточных желез, которые есть и у самок обычных насекомых, но служат для более прозаических целей, таких как производство компонентов яйцевых оболочек...


Читать на Элементах: "Прочтен геном самой кровожадной мухи на свете"


imbg: (Default)
 Биология не раз переживала новое рождение: быв сначала «полевой» наукой, изучавшей животных и растения, в XX веке она значительно переместилась в лаборатории, концентрируясь на молекулярных основах жизни и наследственности. В XXI веке история двинулась дальше: многие эксперименты теперь проводятся на компьютере, а материалом для изучения являются последовательности белков и ДНК, а также информация о строении биологических молекул. В этой статье мы дадим несколько советов тем, кто решил связать свою карьеру с компьютерной биологией, став, тем самым, биоинформатиком.

  


«Биомолекула» довольно много внимания уделяет компьютерной, или, как ее еще называют, «сухой» биологии — современной отрасли биологической науки, в которой главным инструментом исследователя является обычный компьютер. (Правда, частенько приходится прибегать к помощи и не совсем обычных — суперкомпьютеров.) На нашем сайте есть специальная рубрика, посвященная этой науке, — «In silico», — ознакомиться с которой мы и предлагаем заинтересованному читателю. В частности, там идет речь о концепции количественной биологии, о способах вычисления пространственной структуры и динамики биологических молекул (с особенным акцентом на биомембранах и мембранных белках и рецепторах), а также о становлении молекулярной графики. В недавних статьях было рассказано о методах изучения эволюции по молекулярным данным, а также о новой концепции «сухой» биологии, предсказывающей будущее биологии как науки.
 
В этой статье, основанной на переводе недавнего эссе в журнале Nature Biotechnology, мы приводим некоторые советы для начинающих биоинформатиков — исследователей, которые планируют заниматься изучением жизни без отрыва от клавиатуры.

Читать целиком "Я б в биоинформатики пошёл, пусть меня научат!"
imbg: (Default)
Что у некоторых бактерий (в частности, Streptomyces, Borrelia, Rhodococcus) также есть аналоги теломераз




 
Кому интересно - Reverse transcriptase at bacterial telomeres
imbg: (Default)
 Каждый раз, когда клетки делятся митозом или мейозом, их ДНК расплетается и удваивается, умудряясь при этом сохранять свою структуру и целостность. Ювелирная упаковка ДНК (обеспечиваемая гистонами) жизненно важна, ведь именно от неё зависит, какие гены будут считываться и работать в той или иной клетке.



Подробности того, как ДНК удаётся упаковаться каждый раз правильным образом и как происходит транспортировка нужных гистонов к месту сборки, выясняла команда биологов из Биотехнологического центра исследований и инноваций Университета Северной Дании и Университета Копенгагена. Эта работа вошла в кандидатскую диссертацию Илназ Климовской, сейчас — менеджера медицинских и научных проектов в «Новартис Фарма» в Москве. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature Communications.

Читать целиком - "Катится, катится к ДНК гистон"
imbg: (Default)
 Сложить журавлика из бумаги — легко! Сложить журавлика из молекулы ДНК... тоже легко! Немного усидчивости и мастерства позволяют своими руками создавать из бумаги настоящие произведения искусства. Молекулы ДНК, в свою очередь, не требуют специальных навыков и собираются в красивые структуры на подобие оригами легко и непринужденно!



Звучит как бред сумасшедшего, скажете вы. Отнюдь! Из этой статьи вы узнаете, как создать свою собственную фигурку оригами из ДНК, как похитить золото с помощью роботов, и кто победит в схватке между тараканом и ДНК-машиной.

Читать целиком - "ДНК-оригами: путь от гравюры до нанороботов длиной в 30 лет"
imbg: (Default)
Наша лаборатория выпустила новую статью.



В контексте ЖЖ тут  интересна не сама сказка, сколько присказка - как эта статья публиковалась. Два (!) года назад она была написана в первоначальном виде. Нам показалось, что статья получилась отличной - есть там и молекулярная биология, и нокаутные мыши, и актуальное сейчас воспаление кишечника крепко связывалось с присутствием или отсутствием экспрессии одного гена. В общем, ничтоже сумняшeся, отправили мы манускрипт в Nature Medicine.

Редактор ее принял благосклонно, и отправил на рецензию. Месяц ждем, второй. Рецензия пришла злая - то фи, это фи, тут добавить, тут убрать, в общем нам не нравится. Обидно было, что некоторые (при чем, основные) замечания были не  очень справедливы. Например, мы моделировали воспаление кишечника у мышей соединением DSS (производное декстрана) - этот полисахарид царапает стенки кишечника и не переваривается, картина получается адекватна человеческому воспалению. Это такой же стандарт, как аллоксановый диабет у крыс, и используется весьма уважаемыми учеными. 

Однако один рецензент, гвоздь ему в голову, уперся - неадекватная модель и все тут. А сделайте вы лучше cecal ligation and puncture (CL&P). Тогда поверим. CL&P,  для тех кто не знает, процедура проще некуда - берется мышка, под наркозом разрезается пузико, достается тонкая кишка, перевязывается ниткой (модель запора), и несколько раз протыкается иголкой, чтоб содержимое кишки попало в брюшную полость и вызвало заражение. После мышку аккуратно зашивают, выводят из наркоза и недельку-другую наблюдают на предмет температуры и общего состояния. И так 10 раз (в смысле, 10 мышей прооперировать, чтоб статистика не ругалась). И еще 10 раз - с нокаутными мышками. Всего 20 операций. Спасибо хирургам из соседнего отдела, предоставили все необходимое и активно помогли...

Результат - наша теория укрепилась, 
CL&P полностью подтвердило - без гена нашего кранты, не может иммунная система остановится когда надо - уже ни одной бактерии нет в брюшной полости, а у нокаутных мышей воспаление полыхает что твой Майдан! Кстати, интересно, что из 10 здоровых мышей после всех издевательств 6 выжили и выздоровели - нитку перегрызли ферментами и макрофагами, дырки в кишках заштопали!

Прошло полгода. С грехом пополам большую часть требований выполнили, остальные как могли устранили окольными способами. Шлем статью обратно. Месяц ждем, второй. Приходит ответ - все равно нам не нравится. Тут статистика не такая, да и новизна как-то статьи не радует. Давайте, подрихтуйте тут и там, и присылайте.

Рихтуем, пересчитываем, перефразируем - три месяца пролетело. Шлем обратно. Месяц ждем, второй. Приходит короткая рецензия - нам не нравится, новизны нет, а мы журнал элитный - в общем получите отказ, файлы все мы удаляем, good bye!

Поплакала первый автор, шеф смурным походил - делать нечего, прощай Nature! Пошли к тем, кто попроще. Естественно, после всех кульбитов с доработками статья уже была на порядок качественнее, опубликовать ее долго времени не  заняло. Однако те год-полтора бодания с Nature научили нас тому, что ни в одном университете не скажут.

Всегда стоит держать в уме, начиная новую тему, что качественно сделать историю и написать на хорошем языке не достаточно. История должна быть абсолютно новой. Мы ранее еще публиковали, что наш ген в клетках ингибирует иммунный ответ. Кроме того, геномные скрининги показали,что он участвует в росте опухолей. В новой статье мы подтвердили оба факта, использовав уже мышей с нокаутом этого гена, и показали те же эффекты на организменном уровне. Оказалось - нет, новизны тут нет, это формально говоря - доработка результатов. Вот если б на мышах была показана предрасположенность скажем к диабету или сердечно-сосудистым заболеваниям - тогда это новое направление. А так - высоко-импактовым журналам история не интересна. Хороший урок.
 
imbg: (Default)
 Наверное, никого не поставит в тупик вопрос, какого он пола, однако на вопрос «что нужно для того, чтобы родиться девочкой/мальчиком?» никто так и не даст исчерпывающего ответа. Американский психолог Джон Мани описал схему формирования пола у человека, состоящую из девяти этапов, или ступенек, которым и посвящена эта статья.

  

Читать целиком - "Что такое пол?"
imbg: (Default)
Признайтесь, как часто вы слышали о Чернобыльской аварии и сотнях тысяч погибших из-за неё? Пугали ли вас невидимыми смертоносными лучами всепроникающей радиации, под действием которой люди превращаются в страшных многоруких мутантов?

Сталкивались ли вы с мнением, что предпосевное облучение семян сельскохозяйственных культур — это геноцид? Если ваш ответ «да» — примите мои поздравления, вам довелось пообщаться с типичными представителями довольно распространённого на нашей планете сообщества радиофобов.

  

Читать целиком - "Радиофобия. Сон разума порождает чудовищ"
imbg: (Default)
 Исследование окружающего нас мира всегда начинается с описания его составных частей. На заре развития химии ученые большую часть времени описывали свойства и состав различных веществ. Позже они стали пытаться синтезировать эти вещества и обнаружили, что это позволило им еще глубже понять законы строения материи.



Похожим путем сейчас идет и молекулярная биология — от эпохи разбора клетки «на запчасти» и секвенирования геномов всевозможных организмов к созданию синтетического генома с новыми свойствами. Первым шагам к этому было создание синтетического генома бактерии в Институте Вентера. Новый виток развития молекулярной биологии — создание дрожжей S. cerevisiae с измененным синтетическим геномом, который ученые называют Sc2.0. Статья рассказывает о первом успехе этого проекта — синтезе первой эукариотической хромосомы.

Очередная статья новой звезды Биомолекулы.ру Виктории Коржовой: "Синтетическая хромосома"
imbg: (Default)
Слушал доклад вчера, молодой медик показывал результаты своих исследований...

Оказалось, что водка и прочий крепкий алкоголь вызывает при крепком употреблении (пол-бутылки на брата/вечер) не сильное воспаление гепатоцитов, т.е. основных клеток печени. Воспаление не понарошку - анализы показывают картину, близкую к бактериальному сеспису (не знаю, может ли быть бактериальное заражение печени в жизни, надеюсь медики меня поправят). После похмелья Через 12 часов симптомы пропадают.



Суть доклада - экспериментальное подтверждение на мышах, коих поили спиртом насильно пипеткой, что воспаление вызывается вследствие следующих событий:

1. Спирт коагулирует белки слизистой оболочки кишечника;
2. Комменсальная микрофлора (бактерии у нас в кишечнике) и частицы их оболочки (по научному, бактериальные липополисахариды, или LPS) попадают в кровоток;
3. Кровь несет все это по портальной вене в печень:
4. Печень реагирует воспалением.

Если пить не часто и не много, - ничего страшного, печень справляется.

Если бухать постоянно - хроническое воспаление, что может ускорять развитие цирроза (я как-то пропустил, может ли это само по себе приводить к циррозу, или оно только усиливает отравляющее действие высоких количеств алкоголя на печень).

В общем, пьянству бой!


imbg: (Default)
За что подверглась критике компания 23andMe? Какие возможности на сегодняшний день существуют у генетического тестирования?

О чем не могут договориться между собой специалисты — врачи и генетики? Представляем вашему вниманию анализ плюсов и минусов популярной услуги — анализа ДНК.

 

Читать "Генетическое тестирование и патернализм в медицине".
imbg: (Default)
Некомпетентно составленные заголовки сообщений на научную тематику вводят читателя в заблуждение и приводят специалистов в ярость. То и дело можно услышать или прочитать об открытии «генов гениальности», «генов счастья», «генов патриотизма», «генов алкоголизма».



Данная проблема не нова. Этим грешат даже медиа-гиганты — признанные киты информационного океана, на поверхности которого начались очередные волнения: на роль пресловутого «гена гениев» выдвигают ещё одного претендента: ген NPTN.

Как начинающему научному журналисту не утонуть в этом океане самому и не утопить других? Предлагаю свой ответ на данный вопрос.

Читать полностью: "
Ген гениев, или «Как заставить научное сообщество вас ненавидеть. Быстро, недорого, навсегда»"
imbg: (Default)
Известно, что при воспалении клетка экспрессирует про- и антивоспалительные гены тремя волнами. Эти гены условно делят на ранние (мРНК появляется в течении минут после начала воспаления), промежуточные(несколько часов), и поздние (мРНК появляется только спустя 12-24 часов после воспаления).




Недавняя статья группы под руководством нобелевского лауреата Давида Балтимора (того, что открыл реакцию обратной транскрипции) показала, что гены всех трех групп транскрибируются одновременно, однако зрелые мРНК в цитоплазме появляются сначала для ранних генов, потом для промежуточных и в конце концов для поздних. Это говорит о том, что сплайсинг пре-мРНК является еще одним регулятором генной экспрессии, и подводит к важности интронов, как инструментов для такой регуляции.

Биомолекула.Телетайп
imbg: (Default)
Оказалось, что антиоксиданты ускоряют рост раковых клеток (рак легких). Т.е. говорить о необходимости в наше суровое время кушать антиоксиданты курильщикам (помню, морковку им сватали активно), чтоб снизить вред сигарет - с сегодняшнего дня уже не коректно.



В целом, в статье упоминают, что польза от антиоксидантов была не подтверждена, а кое-где даже и наоборот, при целом ряде хронических недугов и онкологических заболеваний.

Подробнее...

Profile

imbg: (Default)
Neo-IMBG

February 2015

S M T W T F S
1234567
891011121314
15161718192021
2223 2425262728

Syndicate

RSS Atom

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Oct. 24th, 2017 02:13 am
Powered by Dreamwidth Studios