imbg: (Default)
Neo-IMBG ([personal profile] imbg) wrote2011-05-21 07:06 pm
Entry tags:

Студенту на заметку

 Основное требование при работе в лаборатории - не загрязнить исходные растворы при пипетировании. Смысл вроде понятен - любой реактив в молекулярной или клеточной биологии - это прозрачный раствор, и кроме веры в этикетку, нет никакой реальной возможности проверить, на сколько его состав соответствует написанному на стенке пробирки. Особенно критична поддержка чистоты при работе с культурами клеток - лишенные охранных систем организма, культуры клеток беззащитны при случайном заражении микробами, которые взрывоподобно размножаются в тепличных условиях чашки Петри.


Смена среды для роста клеток - критичный момент в сохранении культуры клеток

Все изложенное выше понятно, но реальная жизнь вносит свои коррективы. В частности, считается что добавлять один и тот же раствор в разные пробирки можно одной пипеткой, если кончик пипетки держать на весу, т.е. не дотрагиваться ни до чего: после небольшой тренировки это не сложно делать. И, как правило, рутинно меняя среду ДМЕМ в разных чашках с культурами клеток, многие пипетку не меняют и используют для всех чашек - иногда с разными линиями клеток. То же самое принято делать и в генной инженерии - имея ряд эппендорфов, для раскапывания одного и того же реагента носик можно не менять.

Подсознательно я всегда избегал этого, потому что даже не дотрагиваясь, вы все равно создаете мостик между пипеткой и чашкой - в виде струи жидкости. Правда напор идет от пипетки к чашке, т.е. течение будет препятствовать обмену веществ между ними. 

Оказалось, что мое недоверие оправдано - в статье "Upstream contamination in water pouring" опубликованны данные, что в силу сложных физических особенностей потоков частички, а значит и микробы, могу идти снизу вверху против течения - прям как лосось по водопаду. Так что не жалейте пипетки и носики, если хотите закончить эксперимент корректно и в срок - потому что часто даже ничтожные количества вещества достаточно, чтоб законтаминировать исходный раствор.

По наводке Lenta.ru/Science

[identity profile] mochalkina.livejournal.com 2011-05-22 06:39 am (UTC)(link)
а сейчас носики де-факто одноразовые или, как двадцать лет назад, тщательно моются и используются повторно? Когда я делала диплом, мы и одноразовые пробирки мыли, по бедности-то.

[identity profile] imbg.livejournal.com 2011-05-22 06:45 pm (UTC)(link)
я уже 6 лет как уехал, по слухам - уже не моются.

физхимия

[identity profile] kotvaska16.livejournal.com 2011-05-23 06:00 am (UTC)(link)
у нас носики одноразовые, пластиковые. чьего производства эти дозаторы - я не помню так сходу

(Anonymous) 2011-05-23 06:10 am (UTC)(link)
В многих местах все еще одноразово-многоразовые.

[identity profile] v1adis1av.livejournal.com 2011-05-22 09:33 am (UTC)(link)
Можно сделать простой и быстрый эксперимент для проверки, переносятся ли клетки вверх по струе из пипетки. Физический эксперимент биологическими методами -- было бы красиво.

[identity profile] imbg.livejournal.com 2011-05-22 06:49 pm (UTC)(link)
по ощущениям - иногда да, контаминация непонятным способом передается от зараженной чашки в общую бутылку. Но сделать корректный эксперимент будет сложно - есть же еще токи воздуха, да и просто другая инфекция может залететь.
Второй пример, который можно проверить - контаминация праймеров другими праймерами. Но опять же - исключить перенос по воздуху и еще триста причин, которые могут теоретически случиться, очень сложно.
Поэтому я наверное не взялся бы такой эксперимент исполнить :/

[identity profile] sharov43.livejournal.com 2011-05-22 09:54 am (UTC)(link)
-- И, как правило, рутинно меняя среду ДМЕМ в разных чашках с культурами клеток, многие пипетку не меняют и используют для всех чашек - иногда с разными линиями клеток.

Гнать таких надо.

самый умный, что ли?

[identity profile] vgo.livejournal.com 2011-05-22 01:37 pm (UTC)(link)
условия эксперимента в статье сильно отличаются от пипетирования среды в чашку Петри.

[identity profile] imbg.livejournal.com 2011-05-22 06:46 pm (UTC)(link)
рутина заедает - много раз видел такое

[identity profile] sharov43.livejournal.com 2011-05-23 02:18 am (UTC)(link)
В одном ламинаре одновременно флаконы с разными культурами - это ахтунг. А тут одной пипеткой. Вообще-то, технологичнее каждый раз из бутылки среду в ЧП. А затем в ЧП, а не в бутылку пипеткой.
Впрочем, за рутину говорит статистика: до 15% лабораторных линий контаминированы. Это как-то ATCC публиковало.

[identity profile] alexthunder.livejournal.com 2011-05-22 07:53 pm (UTC)(link)
Тоесть поссать где попало тоже не безопасно. Там могут оказаться злобные микробы которые только и ждали шанса совершить апстрим. :))

[identity profile] drnovikov.livejournal.com 2011-05-23 06:07 am (UTC)(link)
И контаминировать-таки пипетку!

[identity profile] alexthunder.livejournal.com 2011-05-23 07:33 am (UTC)(link)
Ага, контаминировать и делать её очень контэйджис... :)))

Не контаминируй пипетку!

[identity profile] drnovikov.livejournal.com 2011-05-23 06:09 am (UTC)(link)

"Не контаминируй пипетку!"

[identity profile] radio-developer.livejournal.com 2011-05-23 06:59 am (UTC)(link)
я больше никогда не буду плевать в унитаз.

[identity profile] emuzychenko.livejournal.com 2011-05-23 09:40 am (UTC)(link)
Наверняка и мелкие брызги, выбиваемые каплей при падении, в изобилии попадают на пипетку.

Например, до 80-х при проведения массовых инъекций были очень популярны безыгольные инъекторы - считалось, что они исключают перенос инфекций с кровью. При более пристальном рассмотрении оказалось, что струя раствора, впрыскиваемая под высоким давлением даже без контакта сопла с кожей, таки выбивает из кожи мелкие фрагменты тканей с брызгами крови, поэтому в конце 80-х применение инъекторов было сильно ограничено, а впоследствии были разработаны различные способы защиты (одноразовые колпачки, очистка струей сжатого воздуха и т.п.).

[identity profile] imbg.livejournal.com 2011-05-23 05:23 pm (UTC)(link)
то-то они так и не победили инъекционные формы. Я помню, именно в 80-90 была струя - дескать игла это больно, а безинекционные способы заменят стальную иглу, особенно у диабетиков и других хронических больных, которым требуются частые инъекции. И лишь некоторые уповали на новые технологии иголок - тоньше, меньше трения и т.п. Сейчас смотрю, что все-таки цена/качество осталось за иголками, которые и правда стали почти неощущаемые

[identity profile] emuzychenko.livejournal.com 2011-05-24 03:09 am (UTC)(link)
В плане замены иголок они могли заменить только подкожные инъекции - при любом давлении струя проникала очень неглубоко. Безыгольники активно внедряли, в первую очередь, благодаря высокой скорости работы, считая их инфекционно безопасными, особенно при применении неспециалистом - дескать, любой прапорщик может взять инъектор, и быстренько вакцинировать роту солдат в зоне бактериального заражения.

[identity profile] in-silver-mask.livejournal.com 2011-05-23 10:11 pm (UTC)(link)
В таком случае, переносить раствор не струйно, а капельно, должно быть безопаснее ))

[identity profile] imbg.livejournal.com 2011-05-23 10:21 pm (UTC)(link)
Беда в том, что когда это делаешь каждый день с десятком чашек - по два-три часа в день, и так несколько лет - все ухищрения уходят сами собой - остается чистый костяк необходимых действий. Рутина - она съедает все лишние движения :)

[identity profile] sinyaya-tigra.livejournal.com 2011-05-24 02:47 pm (UTC)(link)
У меня сделались неожиданные ассоциации ))
http://sinyaya-tigra.livejournal.com/37172.html