Графиня изменившимся лицом бежит пруду

 

Калиевый канал in silico

Несмотря на то, что за несколько десятилетий существования метода моделирования молекулярной динамики (МД) сущность подхода практически не поменялась, совершенствование алгоритмов и взрывное развитие компьютерных мощностей позволяет достигать все новых рубежей. Американские исследователи провели моделирование МД потенциал-чувствительного калиевого канала, в результате чего удалось в деталях проследить процесс активации / инактивации этого белка, «рассмотрев» подробности, ранее известные лишь гипотетически.

 
Структурная биология уже более 15 лет назад расшифровала строение K+-канала: сначала «обычного», потом и потенциал-чувствительного. (На самом деле, у человека более 40 типов разных K+-каналов, так что разнообразие не ограничивается двумя названными типами ;-) Однако особенность приготовления образцов для рентгеноструктурного анализа или спектроскопии ядерного магнитного резонанса (основных методов определения строения биомолекул) такова, что в эксперименте невозможно сохранить ТМ-потенциал, и все структуры каналов из-за этого получаются «открытыми» (то есть, активированными). До сих пор неизвестно строение неактивного (закрытого) канала, а значит и подробности цикла активации / инактивации неизвестны тоже.

Выход из сложившегося положения предлагает группа американских биофизиков во главе с Дэвидом Шоу (David Shaw), заслужившим себе репутацию на мировом финансовом рынке, а потом неожиданно «переквалифицировавшимся» в компьютерную молекулярную биологию...

Читать целиком "Калиевый канал in silico"

 

Немного статистики

Лента.ру опубликовала интересный обзор статьи о том, как размножались финские фермеры с 1760 по 1849 года - тогда как раз, когда небо было голубее, трава зеленее, а человечество не травили вакцинами и ГМО (хотя строго говоря, уже тогда все с/х культуры были ГМО). Итак, как же жили предки в вольной природе с прекрасной экологией?



...Авторы установили, что в исследованный период до 15 лет не доживала почти половина из родившихся, а из тех, кто доживал, 20 процентов не вступали в брак, и, соответственно, не передавали свои гены следующим поколениям. Таким образом, делают вывод ученые, борьба за существование в это время продолжалось на уровне, более чем достаточном для естественного отбора полезных и отбраковывания вредных генетических особенностей.

Оказалось, что давление отбора не отличалось у имеющих земельные наделы и безземельных крестьян. То есть материальное состояние в аграрном обществе было не способно защитить его обладателей от негативного влияния среды...

Т.е. каждый второй ребенок умирал по той или иной причине еще во время школы. Из оставшихся - каждый пятый не размножался. Это и есть приблизительная цена здоровья популяции. Сегодня, когда высшей ценностью обьявлен индивид, а не популяция, такая статистика кажется ужасной. 

Единственный выход - дальше  развивать медицину, легкую промышленность и все остальные прелести цивилизации - включая межзвездные перелеты для вывоза растущей популяции на курорты других планет. Да, тогда нам предстоит переиграть природные законы, а это наверняка очень трудно. Но по другому уже не получится - сегодня ни один человек не согласится на жизнь в согласии с природой с условием, что половина его детей гарантированно не доживет до паспорта.

Читать целиком