imbg | Entries tagged with biomolecula

Всем известен «стандарт» женской красоты — 90–60–90. Особенно «пугающей» цифрой из этой тройки кажется 60, а именно — обхват талии. Для достижения желанных 40 кило многие девушки сидят на жёстких диетах, ограничивают себя в еде и радуются каждому ушедшему килограмму. Стоп, девушки! Остановитесь!

Недавняя работа показала — клетки, присутствующие в жировой ткани, важны для иммунитета и защищают нас от инфекций: в частности, от золотистого стафилококка.

Читайте дальше - "Полюби свои жировые клетки!"

В номере журнала Nature 517(7533), вышедшем 8 января 2015 года, рассказывается о нейро-компасе летучих мышей, кишечной микрофлоре, двойной роли глутатиона и простагландина, страстях ископаемых рыб, перипетиях B- и T-лимфоцитов, восстановлении нервов у червей и тепловом эффекте ферментативных реакций.

Читать полностью - Nature #517(7533)

Биомолекула.ру объявляет вакансию технического редактора.

Мы ищем технического редактора-супермена, обладающего практически не встречающимся в дикой природе набором качеств:

1. Врожденная грамотность;

2. Непревзойденное умение оформлять и вычитывать тексты;

3. Искренняя симпатия к «Биомолекуле»*,

4. Хотя бы базовые представления о современной биологии;

5. Базовые навыки работы с растровой и векторной графикой;

6. Умение загружать файлы на сервер и скачивать их обратно, когда они там больше не нужны (шутка);

7. Знание html на уровне верстки текста, картинок и таблиц;

8. Исполнительность и пунктуальность (не шутка).

Кто узнал в перечисленных выше пунктах себя — пришлите на наш редакционный адрес (editorial@biomolecula.ru) короткий рассказ о себе и свое резюме до 16 января 2015 года. Ждем ваших писем!

* - это значит — желание работать не только за деньги, хотя и не забесплатно. Дополнительной мотивацией должна стать перспектива вхождения в команду «Биомолекулы».

В 2015 году «Биомолекула» будет иногда делать дайджесты биологических статей основных естественнонаучных журналов — Nature и Science. По ссылке первый выпуск, посвященный номеру Nature #517, вышедшему 1 января 2015 года.

В выпуске:

Молекулярная биология и биоинформатика. Обнаружен еще один, доселе неведомый, слой в многослойной регуляции трансляции. Все завязано непосредственно на рибосому: особые последовательности мРНК, напоминающие IRES, крепко цепляются за рибосому и изменяют уровень трансляции своей мРНК. Это поражающее воображение явление показано пока только для Hox-генов мышей и видимо играет роль при эмбриогенезе. — RNA regulons in Hox 5′ UTRs confer ribosome specificity to gene regulation.

Структурная биология. С помощью электронной криомикроскопии детально исследована структура и конформационные переключения рианодинового рецептора млекопитающих. Без рианодиновых рецепторов возбудимые ткани не были бы такими возбудимыми, и знание их конформационных интимностей архиважно и архинужно. — Architecture and conformational switch mechanism of the ryanodine receptor.Structure of a mammalian ryanodine receptor, Structure of the rabbit ryanodine receptor RyR1 at near-atomic resolution.

Молекулярная эволюция. Оказывается, гены чаще переносились от бактерий к археям, а не наоборот. Показано на основе исследования 134 архейных и 1847 бактериальных геномов. Значит, перенос генов от бактерий мог стать толчком для появления многих архейных групп. — Origins of major archaeal clades correspond to gene acquisitions from bacteria.

Рак и стволовые клетки. Еще оказывается, что рецептор протеина С может быть маркером стволовых клеток молочной железы мышей. Возможно, с помощью этой информации получится выяснить что-то про патогенез рака молочной железы. —Identification of multipotent mammary stem cells by protein C receptor expression.

Вирусология. Получена кристаллическая структура вируса гепатита А. Оказывается, он напоминает пикорно-подобные вирусы насекомых. Эта информация может не только помочь в борьбе с этим вирусом, но и пролить свет на эволюцию прочих пикорн. — Hepatitis A virus and the origins of picornaviruses.

Иммунология. Белок ISG15 — это примерно такая же черная метка, как убиквитин. Показано, что этот белок играет важную роль в «отстреле» лишних интерферонов I типа, и при его дефиците начинаются нешуточные аутоиммунные реакции. — Human intracellular ISG15 prevents interferon-α/β over-amplification and auto-inflammation.

Молекулярная биология. Во время митоза в клетке активны киназы, а чтобы выйти из митоза, клетке надо успокоиться и включить в себе фосфатазы. Две из этих фосфатаз — PP1 на PP2A — включаются очень красивыми каскадами при выходе из митоза у дрожжей и, видимо, у всех эукариот. — A PP1—PP2A phosphatase relay controls mitotic progression.

Биофизика, биоэнергетика, структурная биология. Получена нативная структура фотосистемы II с разрешением в 1.95 Å. Вынос мозга. — Native structure of photosystem II at 1.95 Å resolution viewed by femtosecond X-ray pulses.

Структурная биология. Получена структура Δ14-стерол редуктазы бактерии Methylomicrobium alcaliphilum, — фермента, гомологичного важным ферментам млекопитающих, вовлеченным в метаболизм холестерина. Возможно, эта структура поможет понять патогенез некоторых человеческих заболеваний. — Structure of an integral membrane sterol reductase from Methylomicrobium alcaliphilum.

Читать весь выпуск

У всех современных организмов клеточная мембрана играет принципиальную роль в энергетическом обмене и других биохимических процессах. Новые исследования эволюции мембран позволяют ответить на многие каверзные вопросы: как мембрана появилась у нашего далекого предка LUCA, почему мембраны бактерий и архей так непохожи и каким образом эукариоты обзавелись мембранными органеллами.

Читать целиком - "Появление и эволюция клеточной мембраны"

«Биомолекула» ежегодно проводит конкурс на лучшую научно-популярную публикацию в области современной биологии. Четвертый конкурс «био/мол/текст» вновь собрал авторов, способных корректно, доступно и с задорной искрой рассказать читателю о достижениях биомолекулярной науки. В этот раз особое внимание мы уделили биоинформатике и молекулярной эволюции. Конкурс был реализован при поддержке ОАО РВК.

Мы получили 87 заявок на участие, из которых 49 работ прошли внутренний отбор в редакции и к 28 ноября были опубликованы на сайте и доступны для ознакомления сейчас и в дальнейшем. Жюри конкурса, как всегда, пришлось помучиться с тем, чтобы выбрать лучших из лучших, и вот, наконец, 21 декабря 2014 года итоги конкурса подведены.

Победители:

В номинации «Лучший обзор»:

- Пучков Евгений за статью «Флуоресцентные репортеры и их молекулярные репортажи». Приз - 20 тыс. руб.
- Кондратова Мария за статью «Одураченные макрофаги, или несколько слов о том, как злокачественные опухоли обманывают иммунитет». Приз - 5 тыс. руб.

- Ястребова Светлана за статью «Работа курьером, район — организм». Приз - 5 тыс. руб.

Кроме того:

- работы Приказюка Егора («Поиск иголки в стоге сена за 10 минут — подсвети себе LAMPой») и Лебедева Виктора ( «Тонкие нити судьбы») будут опубликованы в «Химии и Жизни»,

- работы Кондатовой Марии, Гущанской Екатерины («Эпигенетика поведения: как бабушкин опыт отражается на ваших генах?»), Скорлупкиной Надежды («Трансгенные растения — спасители планеты или бомбы замедленного действия?») и Никельшпарг Эвелины («Нобель vs. Шнобель, или механизмы магниторецепции») — в «Природе», а

- работы Садчикова Анатолия («Как появились митохондрии (рассказ, похожий на сказку)») и Перцевой Маргариты («Часы старения: обнулить, замедлить, обратить вспять?») — в «Науке и Жизни».

Ну и плюс ко всему, журнал «Химия и Жизнь» награждает Приказюка Егора и Лебедева Виктора подпиской на журнал, «Природа» — Кондратову Марию подпиской на журнал и книгой, изданной к его 100-летию, а «Наука и Жизнь» — Садчикова Анатолия подпиской на журнал и электронным архивом.

В номинации «Лучшее новостное сообщение»:

- Сергеева Дарья за статью «Дай пять: как математика управляет развитием пальцев». Приз - 10 тыс. руб.
- Шандарин Игорь за статью «Желудок размером с горошину + человеческий кишечник, выращенный в мыши». Приз - 3 тыс. руб.
- Валиева Мария за статью «Вирус Эбола и макак-резус: получено новое эффективное лекарство». Приз - 3 тыс. руб.

Кроме того:
- работа Шандарина Игоря будет опубликована в «Химии и Жизни», а ее автор — награжден подпиской на журнал.

В номинации «Своя работа»:
- Ямпольский Илья за статью «Биолюминесценция: возрождение». Приз - 20 тыс. руб.
- Посух Ольга за комикс «Микрогравитация, или похождения мух-космонавтов». Приз - 5 тыс. руб.

- Горяйнова Оксана за статью «От рака вылечит... верблюд!». Приз - 5 тыс. руб.

Кроме того:
- работа Горяйновой Оксаны будет опубликована в «Химии и Жизни»,
- комикс Посух Ольги — в «Науке и Жизни».

Ну и плюс ко всему, журнал «Химия и Жизнь» награждает Горяйнову Оксану подпиской на журнал, а «Наука и Жизнь» награждает подпиской Ямпольского Илью, а Посух Ольгу — книгой Сергея Бакатова «Поговори со мной» (издание «Науки и жизни»).

В номинации «Биоинформатика и молекулярная эволюция»:
- Панчин Александр за статью «Сколько сора в нашей ДНК». Приз - 20 тыс. руб.
- Шичкова Полина за статью «Виртуальные тропы реальных лекарств». Приз - 5 тыс. руб.
- Кондратова Мария за статью «ACSN — глобальный атлас сигнальных путей. От молекулярной географии рака к новым информационным технологиям в биологии». Приз - 5 тыс. руб. получают поощрительные призы 5 тыс. руб.

Кроме того, все трое победителей получат книгу «Логика случая» с автографом ее автора Е.В. Кунина.

Ну и дополнительно:
- работа Шкроб Марии «Что хотел сказать автор?» будет опубликована в «Химии и Жизни», статья Кондратовой Марии — в «Природе», а статья Лапочкина Юрия («Вирусные геномы в системе эволюции») — в «Науке и Жизни».

Приз зрительских симпатий:
- Приказюк Егор за статью «Поиск иголки в стоге сена за 10 минут — подсвети себе LAMPой». Приз - планшетка Samsung Galaxy Tab S.

Фаворитом Фонда поддержки передовых биотехнологий становится Перцева Маргарита за статью «Часы старения: обнулить, замедлить, обратить вспять?» Маргарита получает 15 тыс. рублей и мировой бестселлер, книгу «The Ageless Generation» с подписью автора — ведущего специалиста в исследовании старения Aлекса Жаворонкова.

Хороших работ оказалось так много, что мы не удержались и наградили еще нескольких молодых авторов, не занявших призовых мест в основных номинациях. Приглашения на Зимнюю школу «Современная биология & биотехнологии будущего 2015» получают Попова Валентина, Никельшпарг Эвелину, Валуева Дмитрия, Кротова Антона и Андреева Константина!

***
Остается поблагодарить всех за участие и пожелать удачи и успехов в будущем году! И не забывайте - летом 2015 года мы объявим начало следующего конкурса - "Био/мол/текст-2015"! Оставайтесь с нами!

Читать все статьи конкурса.

Работа представлена на конкурс научно-популярных статей «био/мол/текст»-2014.

Вот уже более 30 лет, с момента создания Г. Шеллом первого трансгенного растения, потребителей беспокоит вопрос о том, безопасны ли генетически модифицированные организмы. Новые гены в них дают большие преимущества перед нетрансформированными сородичами, увеличивая и сохраняя урожай без использования химикатов и гербицидов, но должны ли мы бояться отдаленных последствий воздействия генетически измененных продуктов питания и ограничивать себя в их потреблении?

Что скрывается за аббревиатурой «ГМО» на упаковке моркови, и стоит ли содрогаться при виде этих трех странных букв? Действительно ли опасения имеют почву, или же это дезинформация потребителя производителями традиционных продуктов? Давайте разбираться.

Читать целиком - "Трансгенные растения — спасители планеты или бомбы замедленного действия?"

***
P.S. Пожалуйста, помните - приз зрительских симпатий будет вручен на основе подсчета «лайков», поставленных каждой статье (фирменными кнопочками соцсетей, а также в «социальном» блоке +Share, расположенном под текстом самой статьи). Если нравится статья - "лайкайте".

Читать все статьи конкурса.

Просьба к моим читателям - нажмите пожалуйста ссылку спонсора Биомолекулы.ру, компании Life Technologies. Заодно и брошурку по клеточной биологии получите!

В этом году благодоря им и другим спонсорам призовой фонд конкурса (т.е. деньги, которые будут выплачены победителям) перевалил за 100 000 рублей.

Все работы конкурса "Био/мол/текст-2014" опубликованы.

Матерые авторы и талантливые желторотики; биоинформатика, молекулярка, эволюция, и остальная биология - сорок девять работ в этот раз прорвались на страницы сайта, чтобы побороться за призы жюри и симпатии зрителей (то есть вас, дорогие читатели).

Приз зрительских симпатий (планшет Samsung Galaxy Tab S) выдается на основании лайков и шеров в соцсетях. Внесите свой вклад, сделайте так, чтобы победила по-настоящему достойная работа. Все просто:

1. Пойти по ссылке - http://biomolecula.ru/biomoltext2014;
2. Найти наиболее понравившуюся работу;
3. Поставить «лайк» фирменной кнопочкой соцсетей или через "социальный" блок +Share, расположенной под текстом самой статьи.

Работа представлена на конкурс научно-популярных статей «био/мол/текст»-2014.

Нейробиологи и фармакологи давно работают над созданием веществ, способных оказывать влияние на память. В статье рассмотрены представители некоторых известных на сегодня классов позитивных и негативных химических модуляторов памяти, изменяющих долговременную потенциацию пирамидных клеток гиппокампа. Приводится механизм их действия, область применения и классификация.

Читать целиком - "Химические модуляторы памяти"

***
P.S. Пожалуйста, помните - приз зрительских симпатий будет вручен на основе подсчета «лайков», поставленных каждой статье (фирменными кнопочками соцсетей, а также в «социальном» блоке +Share, расположенном под текстом самой статьи). Если нравится статья - "лайкайте". Тем более, что это статья вышла из-под пера известного вам superhimik'а!

Читать все статьи конкурса.

Статья на конкурс «био/мол/текст»:

Современная молекулярная биология испытывает серьезный системный кризис, связанный с «перепроизводсвом» экспериментальных данных. Но адаптация передовых информационных методов, таких, как технология Google Maps для визуализации молекулярно-биологической информации (система навигации NaviCell) в сочетании с биоинформатическими методами моделирования и анализа, открывает новые возможности для использования данных высокопроизводительных методик.

Читать подробнее - "ACSN — глобальный атлас сигнальных путей. От молекулярной географии рака к новым информационным технологиям в биологии"

Читать все статьи конкурса.

P.S. Пожалуйста, помните - приз зрительских симпатий будет вручен на основе подсчета «лайков», поставленных каждой статье (фирменными кнопочками соцсетей, а также в «социальном» блоке +Share, расположенном под текстом самой статьи). Если нравится статья - "лайкайте", в конце конкурса они будут учитываться.

Статья на конкурс «био/мол/текст»:

Генетический материал, выделенный из доисторических артефактов — костей, зубов, волосяных фолликулов и других сохранившихся тканей, — как правило, не настолько прост, как это кажется многим, однако уже сегодня функционируют несколько десятков лабораторий, которые не боятся трудностей и пытаются заглянуть в далекое (насколько это возможно) прошлое нашей планеты.

Читать подробнее - "Древняя ДНК: Привет из прошлого"

Читать все статьи конкурса.

Вы помните, что на Биомолекуле уже завершается конкурс - работы больше не принимаются, мы будем выкладывать полученные еще в течении недели-двух.

Читать все статьи конкурса.

Генетическая информация в геномах живых организмов постоянно пребывает в состоянии динамического равновесия. Ее количество может возрастать как за счет «самоцитирования» (копирование своей собственной ДНК), так и за счет «плагиата» (приобретения чужеродной ДНК).

С другой стороны, количество генетической информации в геноме может и уменьшаться за счет удаления балластной, с точки зрения клетки, информации. И если смысл обогащения генома за счет чужой ДНК интуитивно понятен, то назначение множественного копирования своих собственных генов далеко не очевидно. Однако этот процесс, получивший название «амплификации генов», чрезвычайно широко распространен в природе, а стало быть, для чего-то клеткам нужен.

Читать подробнее - "Под «генную гармошку»"

Вы помните, что на Биомолекуле уже завершается конкурс - работы больше не принимаются, мы будем выкладывать полученные еще в течении недели-двух. А пока - специальная статья-комикс, котрая тоже участвует в конкурсе:

Читать подробнее - "Микрогравитация, или похождения мух-космонавтов"

Работа представлена на конкурс научно-популярных статей «био/мол/текст»-2014.

ДНК — основное хранилище генетической информации всех живых организмов — подвержена постоянному воздействию разнообразных химических и физических факторов, в результате её структура может нарушиться. Под действием ионизирующего излучения возникают двуцепочечные разрывы — самые опасные повреждения ДНК. В наиболее распространенном механизме «ремонта» таких повреждений главную роль играет Ku-антиген. Кроме того, этот белок имеет множество других удивительных «талантов», изучение которых в настоящее время продолжается.

Исследование механизмов взаимодействия Ku-антигена с ДНК дало возможность разработать новый метод регистрации этого антигена, имеющий важные применения в клинике и исследовательской работе.

Читать целиком - "В лунном свете, или тайная жизнь Ku-антигена"

***
P.S. Пожалуйста, помните - приз зрительских симпатий будет вручен на основе подсчета «лайков», поставленных каждой статье (фирменными кнопочками соцсетей, а также в «социальном» блоке +Share, расположенном под текстом самой статьи). Если нравится статья - "лайкайте", в конце конкурса они будут учитываться.

Работа представлена на конкурс научно-популярных статей «био/мол/текст»-2014.

Во все времена поднимался философский вопрос о свободе воли человека. Кто-то из мыслителей считал, что люди принимают решения самостоятельно; другие утверждали, что всё в мире предопределено, а воля человека — это иллюзия. Современные исследования мозга человека и его поведения вернули старому спору актуальность.

Читать целиком - "Тонкие нити судьбы"

***
P.S. Пожалуйста, помните - приз зрительских симпатий будет вручен на основе подсчета «лайков», поставленных каждой статье (фирменными кнопочками соцсетей, а также в «социальном» блоке +Share, расположенном под текстом самой статьи). Если нравится статья - "лайкайте", в конце конкурса они будут учитываться.

Работа представлена на конкурс научно-популярных статей «био/мол/текст»-2014.

Иммунная система новорожденных детей оказалась не столь беззащитной, как считалось. Ученые из королевского колледжа Лондона обнаружили у малышей новый механизм борьбы с инфекцией, не работающий у взрослых.

Читать целиком - "Сказочка не для взрослых, или об иммунитете новорожденных"

***
P.S. Пожалуйста, помните - приз зрительских симпатий будет вручен на основе подсчета «лайков», поставленных каждой статье (фирменными кнопочками соцсетей, а также в «социальном» блоке +Share, расположенном под текстом самой статьи). Если нравится статья - "лайкайте", в конце конкурса они будут учитываться.

Изобретение микроскопа в позднем средневековье открыло человечеству целый мир, находившийся испокон веков буквально под носом, — например, клеточное строение всех живых организмов и существование бактерий. Однако волновая природа света диктует ограничение на разрешающую способность оптических микроскопов: оно принципиально не может быть лучше 0.2 мкм.

В 2014 году Нобелевскую премию по химии вручили за разработку методов сверхразрешающей микроскопии, позволивших, с использованием ряда ухищрений, преодолеть дифракционный барьер.

Читать целиком - "По ту сторону дифракционного барьера: Нобелевская премия по химии 2014"

Работа представлена на конкурс научно-популярных статей «био/мол/текст»-2014.

В клетках большинства современных организмов имеются митохондрии. Количество их сильно варьирует: от нескольких до сотен тысяч. Митохондрии являются органеллами клеток, но в какой-то мере сохранили свою независимость. Они имеют собственную генетическую информацию, записанную в ДНК, сами синтезируют некоторые белки, способны размножаться делением, могут перемещаться внутри клетки хозяина.

При делении клетки часть митохондрий переходит в новую клетку, и они достаточно быстро восстанавливают свою численность по «согласованию» с хозяином. В начале ХХ века появилась теория симбиогенеза, согласно которой митохондрии появились в результате захвата примитивными клетками (прокариотами) бактерий. В форме сказочного рассказа попытаемся поведать, как это происходило в те далекие времена. Возможно, это в какой-то мере заинтересует детей и привлечет их в биологию.

Читать целиком - "Как появились митохондрии (рассказ, похожий на сказку)"

***
P.S. Пожалуйста, помните - приз зрительских симпатий будет вручен на основе подсчета «лайков», поставленных каждой статье (фирменными кнопочками соцсетей, а также в «социальном» блоке +Share, расположенном под текстом самой статьи). Если нравится статья - "лайкайте", в конце конкурса они будут учитываться.

Каким образом мы определяем свое положение в пространстве? Как мы ежедневно находим дорогу с работы домой даже тогда, когда заходим по пути в магазин? Способность ориентироваться в пространстве — одна из жизненно важных функций мозга всех животных, однако долгое время ученые не могли сойтись во мнении, как мозгу это удается.

В 2014 году Нобелевскую премию по физиологии и медицине получили исследователи «навигационной системы» мозга.

Читать целиком: "GPS в нашем мозге: Нобелевская премия по физиологии и медицине 2014"