![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
Студенту на заметку
Oct. 20th, 2014 04:32 pm Чистые хорошие клетные линии на заказ - Сoriell.org
Заказать можно даже русского с лишней хромосомой - для измерения духовности:
Заказать можно даже русского с лишней хромосомой - для измерения духовности:
CLIME - это новый биоинформатический сервер, который позволяет определить возможные партнеры белков путем анализа схожести эволюционного профиля данного белка с базой остальных белков... Простыми словами, вы задаете список вероятных белков-партнеров (до 200 генов), а программа смотрит: какие из этих белки присутствуют в одних и тех же организмах, а какие нет. По сумме этих факторов вычисляются вероятные парнеры, при чем в ряде случаев предсказания невероятно точные.
Синие квадратики - присутствие указаных 10 белков в различных организмах. Поскольку в данном примере профили очень похожи, то вероятность их взаимодействия выходит высокой - что и требовалось узнать.
Другой, более сложный вариант - под катом:
( Read more... )
Синие квадратики - присутствие указаных 10 белков в различных организмах. Поскольку в данном примере профили очень похожи, то вероятность их взаимодействия выходит высокой - что и требовалось узнать.
Другой, более сложный вариант - под катом:
( Read more... )
Студенту на заметку
Apr. 5th, 2014 09:08 pm Список генов, регулируемых Wnt-путем. Хорошее дополнение к списку NF-kB зависимых генов.
Очень удобно, когда анализируешь данные RNA-seq и ищешь хороший маркерный ген.
Очень удобно, когда анализируешь данные RNA-seq и ищешь хороший маркерный ген.
Molecular Flipbook toolkit (3d animation software designed for and by molecular biologists) - free and open source.
Терапия антителами
Feb. 16th, 2014 06:22 pm Недавно спрашивали меня в комментариях про материалы по терапии антителами. Тут наткнулся на россыпь обалденных видео. Все на английском, но очень доступном. Качество видео очень высокое.
Вставлять видео не позволяют, так что придется смотреть на сайте производителя.
Все ссылки (внизу страниц, выбирайте раздел вручную):
Вставлять видео не позволяют, так что придется смотреть на сайте производителя.
Все ссылки (внизу страниц, выбирайте раздел вручную):
Respiratory, Inflammation and Autimmunity:
Targeting CD-19
Targeting CD-19
Targeting GM-CSF
Targeting IL-1
Targeting IL-5
Студенту на заметку
Jul. 10th, 2013 11:52 amШикарные интерактивные карты клеточных сигнальных путей от R&D - все нажимается и подсвечивается, прям Америка!
Например, вечная дружба инсулина с жиром віглядит упрощенно так:
Например, вечная дружба инсулина с жиром віглядит упрощенно так:
Я нашел то, что мне может быть понадобится в будущем - ни времени, ни сил переводить это сейчас нет. Однако данная статья может быть интересна и вам: о том, как закачивать бактериальные геномы из PubMed.
Given the size of modern sequence databases, finding the complete genome sequence for a bacterium among the many other partial sequences can be a challenge. In addition, if you want to download sequences for many bacterial species, an automated solution might be preferable.
( Read more... )
---------------
NCBI
Given the size of modern sequence databases, finding the complete genome sequence for a bacterium among the many other partial sequences can be a challenge. In addition, if you want to download sequences for many bacterial species, an automated solution might be preferable.
( Read more... )
---------------
NCBI
Статистика для биологов
Feb. 16th, 2013 03:09 pmКороткий синопсис по основным статистическим методам обработки данных для биологов, с основным лейтмотивом "оспади, как же достали ошибки в статьях" - в недавнем Nature: "Know when your numbers are significant".
Статья приятна тем, что дана таблица с основными определениями - теперь ни одна статья не получит от меня положительной рецензии!!
Статья приятна тем, что дана таблица с основными определениями - теперь ни одна статья не получит от меня положительной рецензии!!
Возможность подстелить соломку
Jan. 29th, 2013 02:42 pmСобрание ссылок от NIH по теме - кому и сколько это агенство давало денег в прошлом. Приятно тем, что можно более-менее представить себе конкуренцию на те или иные гранты:
Студенту на заметку
Jan. 7th, 2013 11:51 amHugo Gene Nomenclature Committee - официальный сайт с официальными названиями генов. Что-то вроде ВАКа.
Студенту в помощь
Dec. 1st, 2012 04:59 pmGenevestigator предлагает новый сервис - до конца 2012 года бесплатно. С помощью его можно сравнить результаты анализа экспресси своих генов с данными других исследователей по этим же генам.
Дальше даю английский текст, т.к. тем кому это может быть интересно, перевод вряд ли нужен:
Дальше даю английский текст, т.к. тем кому это может быть интересно, перевод вряд ли нужен:
Dear Genevestigator User,
Has anybody else in the world obtained similar results as you have?
To help you answer this type of question, we just released the "Signature tool" in Genevestigator.
Enter a list of genes and their corresponding expression values (absolute or relative) obtained for instance by RT-qPCR, microarrays or RNAseq, and Genevestigator will search its expression compendium to identify conditions in which the given expression signature occurs.
As an introduction, the Signature tool will be in BASIC access until the end of 2012. It will then become part of Genevestigator ADVANCED. So take advantage of this opportunity to try out this unique tool! For a brief description and tutorial, see here:
https://www.genevestigator.com/gv/doc/signature.jsp
We also announce a significant improvement of the Quick Search and Gene Selection features in Genevestigator. Formerly, when entering a gene ID, Genevestigator sometimes proposed too many genes and probesets. You can now specify whether it should search exact matches or use alternative search options.
Best regards from Zurich,
The Genevestigator Team
