imbg | Установлена структура капсида вируса иммунодефицита человека (Reply)

Последний номер Nature принес хорошую новость - установлена до мельчайших подробностей структура внутреннего капсида вируса, вызывающего СПИД. Напомню, общее строение вируса выглядит приблизительно так:

Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ). - рисунок с Вики

В опубликованной статье доложено об установлении точной характеристики внешней оболочки капсида ВИЧ: на рисунке сверху - четырехугольник из синих точек.

Это важный результат, потому что капсид - это как раз та часть вируса, которая проникает в клетку и несет в себе наследственную информацию вируса. Решить структуру капсида с помощью рентгеноструктурного анализа было не просто, потому что капсид довольно гибкий, и на прямую его закристаллизовать не удавалось. Тогда его стали делить на части. оказалось что белок капсида - СА - образует как пентамерные, так и гексамерные формы. Капсид состоит из 250 гексамеров, в которые внедрены 12 пентамеров. Получив структурные данные по фрагментам, ученые смогли смоделировать все вместе - получилась такая груша:

Белок СА в виде пентамера (золотой) и гексамера (оранжевый), а также капсид ВИЧа целиком

Чем эта новость взбудоражила исследователей? Дело в том, что когда фармкомпании получают строение мишени с атомным разрешением - в большинстве случаев найти химикат, который бы ее (мишень) блокировал, - это чисто техническая задача, для которой нужно пару программ и сильный компьютер. Дальше естественно идут многолетние испытания на живом - но это уже другой вопрос. Остается поверить, что теперь такую же методику мы сможем применить и к вирусу, вызывающему СПИД.

Ссылки по теме:
Статья в Nature: Atomic-level modelling of the HIV capsid
Science Daily
Пресс-релиз института