Молекулярный детектив
Mar. 23rd, 2011 09:28 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
imbgНаконец мир увидил статью скромного индийского аспиранта, Акила Ражпута (Akhil Rajput) - так получилось, что он нечаянно наткнулся на невероятный факт, и распутывал его около 4-х лет. В итоге ученье и труд все перетерло, и результаты работы опубликованы в журнале Immunity "RIG-I RNA Helicase Activation of IRF3 Transcription Factor Is Negatively Regulated by Caspase-8-Mediated Cleavage of the RIP1 Protein".
Если коротко - в статье раскрывается ранее неизвестная связь между двумя абсолютно разными клеточными процессами: каспазой-8 (caspase-8, основной тумблер апоптоза) и рецептором противовирусной обороны RIG-I. До этого момента считалось, что оба пути идут параллельно, но не пересекаются. Оказалось - пересекаются, при чем ого-го как.
Схема-конспект статьи
Самое интересное - как происходило это открытие. В лаборатории, где работают наши герои (под руководством профессора Валлаха) в свое время открыли каспазу-8 (назовем ее для простоты К-8) - поэтому у них в наличии полный набор для работы с ней - свои антитела, киРНК, нокаутные линии клеток и несколько видом нокаутных мышей, у которых ген каспазы-8 выключен в различных вариациях. И при проведении рядового опыта пост-док Акил Рашпут (который в свое время на этой каспазесобаку съел диссертацию защитил) обнаружил, что инфицирование клеток киРНК против К-8 выключал деление клеток. а поскольку они сами ее 20 лет назад и открыли, то это выглядело странно и не логично - такого раньше никто не замечал.
Рашпут с товарищами потянул за ниточку - оказалось, что вмноват вирус, с помощью которого он вводил киРНК. Серия экспериментов показала, что присутствие вируса и отсутствие К-8 каким-то образом гипер-активирует интерферонный ответ, и клетки замирают. Какой путь включает интерфероновые гены в ответ на заражение клетки - это известно. Он поднялся до самого начала этого пути, буквально поштучно перебирая всю сигнальную цепочку - но все равно не нашел конца - почему киРНК и К-8 останавливают пролиферацию клеток.
Наконец, два года назад они открыли, что RIG-I и RIP1взаимодействуют между собой! А RIP1 и К-8 старые друзья - о их отношениях мы знаем уже много. Таким образом, связь нашлась, и еще два года ушло на многочисленные подтверждения этого факта.
В результате, ребята из Вайцманновского института показали - каспаза-8 и RIP1 (два центральных игрока апоптоза) напрямую связываются с анти-вирусным рецептором RIG-I; при чем на рецептор оба белка оказывают противоположное действие. Один - RIP1 - активирует передачу антивирусного сигнала, и клетки "замирают", переставая делиться - это типичная реакция на заражение вирусом, и именно с нее и началась вся сказка.
Второй игрок - каспаза-8 - по своей природе протеаза. Она расщепляет RIP1 (т.е. попросту убивает положительный регулятор), и ослабляет тиски на клетку антивирусного ответа. Таким образом, К-8 служит регулятором глубины ответа на заражение вирусом, не давая клетке "впадать в истерику" и полностью останавливаться в развитии.
Забавно то, что при определенных условиях (напр. при классической активации апоптоза) каспаза-8 наоборот, при заражении убивает клетку (вызывает апоптоз). Вот такой дуализм в клетках - не все однозначно, ичем дальше в механизмы мы забираемся, тем хуже понимаем общую картину. Но это не значит, что мы делаем что-то не так - назовем это время периодом накопления данных.
Ссылка на статью: "RIG-I RNA Helicase Activation of IRF3 Transcription Factor Is Negatively Regulated by Caspase-8-Mediated Cleavage of the RIP1 Protein".
Если коротко - в статье раскрывается ранее неизвестная связь между двумя абсолютно разными клеточными процессами: каспазой-8 (caspase-8, основной тумблер апоптоза) и рецептором противовирусной обороны RIG-I. До этого момента считалось, что оба пути идут параллельно, но не пересекаются. Оказалось - пересекаются, при чем ого-го как.
Схема-конспект статьи
Самое интересное - как происходило это открытие. В лаборатории, где работают наши герои (под руководством профессора Валлаха) в свое время открыли каспазу-8 (назовем ее для простоты К-8) - поэтому у них в наличии полный набор для работы с ней - свои антитела, киРНК, нокаутные линии клеток и несколько видом нокаутных мышей, у которых ген каспазы-8 выключен в различных вариациях. И при проведении рядового опыта пост-док Акил Рашпут (который в свое время на этой каспазе
Рашпут с товарищами потянул за ниточку - оказалось, что вмноват вирус, с помощью которого он вводил киРНК. Серия экспериментов показала, что присутствие вируса и отсутствие К-8 каким-то образом гипер-активирует интерферонный ответ, и клетки замирают. Какой путь включает интерфероновые гены в ответ на заражение клетки - это известно. Он поднялся до самого начала этого пути, буквально поштучно перебирая всю сигнальную цепочку - но все равно не нашел конца - почему киРНК и К-8 останавливают пролиферацию клеток.
Наконец, два года назад они открыли, что RIG-I и RIP1взаимодействуют между собой! А RIP1 и К-8 старые друзья - о их отношениях мы знаем уже много. Таким образом, связь нашлась, и еще два года ушло на многочисленные подтверждения этого факта.
В результате, ребята из Вайцманновского института показали - каспаза-8 и RIP1 (два центральных игрока апоптоза) напрямую связываются с анти-вирусным рецептором RIG-I; при чем на рецептор оба белка оказывают противоположное действие. Один - RIP1 - активирует передачу антивирусного сигнала, и клетки "замирают", переставая делиться - это типичная реакция на заражение вирусом, и именно с нее и началась вся сказка.
Второй игрок - каспаза-8 - по своей природе протеаза. Она расщепляет RIP1 (т.е. попросту убивает положительный регулятор), и ослабляет тиски на клетку антивирусного ответа. Таким образом, К-8 служит регулятором глубины ответа на заражение вирусом, не давая клетке "впадать в истерику" и полностью останавливаться в развитии.
Забавно то, что при определенных условиях (напр. при классической активации апоптоза) каспаза-8 наоборот, при заражении убивает клетку (вызывает апоптоз). Вот такой дуализм в клетках - не все однозначно, ичем дальше в механизмы мы забираемся, тем хуже понимаем общую картину. Но это не значит, что мы делаем что-то не так - назовем это время периодом накопления данных.
Ссылка на статью: "RIG-I RNA Helicase Activation of IRF3 Transcription Factor Is Negatively Regulated by Caspase-8-Mediated Cleavage of the RIP1 Protein".
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2011-03-24 05:27 am (UTC)Yakov Krelin
Date: 2011-03-24 08:26 am (UTC)no subject
Date: 2011-03-24 08:50 am (UTC)Spasiba
Date: 2011-03-24 08:58 am (UTC)no subject
Date: 2011-03-24 02:56 pm (UTC)Re: Spasiba
Date: 2011-03-24 07:27 pm (UTC)http://translate.google.com/translate?js=n&prev=_t&hl=en&ie=UTF-8&layout=2&eotf=1&sl=en&tl=ru&u=http%3A%2F%2Fimbg.livejournal.com%2F82107.html
no subject
Date: 2011-03-24 07:28 pm (UTC)