Aug. 16th, 2011

imbg: (Default)
В процессе написания гранта я понял, что мое математическое образование хоть и было хорошим, и дало мне толчок к "вершинам духа", но за n-лет биологической работы сошло на  абсолютный ноль.

До сих пор я помню только, что площадь под кривой можно посчитать с помощью аналитических весов, вырезав ее хирургическими ножничками из миллиметровки, исравнить ее вес (весы дают точность до сотен микрограммов) со стандартом - квадратиком из той же миллиметровки  площадью 1 кв.см. Этих знаний мне не достаточно для определения одной функции.



На рис выше представлен график деградации моего белка. Товарищ batch2k помог мне ее изобразить, выслушав мои несвязные бормотанья с грамматическими описками.

Однако я хочу, чтоб было красыво:

1. у = 100%  при х=0 (старт)
2. Красивый сигмообразный склон почти до нуля, но не в ноль. Кривая идет вниз на 15-ой минуте, и после 20 выравнивается где-то очень рядом с осью х и идет так вдоль минут 15-20.
3. Через 45 минут кривая опять сигмообразно взмывает вверх и выходит на плато .
4, В идеально варианте кривая не симметричная, а чуть заваливается вправо, после 40 минуты.

Мой вопрос - есть  ли какая-нибудь красивая функция, хоть приблизительно описывающая такой шедевр?

Надеюсь что для физиков и математиков задача не  сложная. А я вам за это про ДНК потом расскажу.

imbg: (Default)
Недавно наш коллега по Биомолекуле batch2k ездил на конференцию. Традиционный рассказ у него в днявке:



8–12 августа 2011 г. в Петрозаводске прошел 5-й российский симпозиум «Белки и пептиды», организованный при поддержке Института биологии РАН Карельского научного центра РАН. Ну и хватит об этом. Теперь главное — о Карелии и эксклюзивном времяпрепровождении. 



читать дальше (много фотографий)
imbg: (Default)
 
Давно или нет, но BLAST дополнился еще одной функцией - расчет праймеров все мастей он-лайн. я на сайт наткнулся только сегодня - о чем спешу сообщить: Primer BLAST


Скрин сайта

Подбор происходит просто - копируете вашу последовательность, и дальше отмечаете - какую длинну желаете, какую часть гена вам надо, температуры, а также что очень полезно - сразу прогнать праймеры вдоль геномной базы для проверки специфичности. 

В итоге получаете хорошие праймеры, которые должны работать и не задаваться. Прямо как в Vector NTI, только бесплатно и законно!


Primer BLAST

Profile

imbg: (Default)
Neo-IMBG

December 2020

S M T W T F S
  12345
6789101112
13 141516171819
20212223242526
2728293031  

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jul. 19th, 2025 01:36 am
Powered by Dreamwidth Studios