![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
imbgCLIME - это новый биоинформатический сервер, который позволяет определить возможные партнеры белков путем анализа схожести эволюционного профиля данного белка с базой остальных белков... Простыми словами, вы задаете список вероятных белков-партнеров (до 200 генов), а программа смотрит: какие из этих белки присутствуют в одних и тех же организмах, а какие нет. По сумме этих факторов вычисляются вероятные парнеры, при чем в ряде случаев предсказания невероятно точные.
Синие квадратики - присутствие указаных 10 белков в различных организмах. Поскольку в данном примере профили очень похожи, то вероятность их взаимодействия выходит высокой - что и требовалось узнать.
Другой, более сложный вариант - под катом:
Тут анализ показывает, что только три первых белка из списка (красный маркер) возможно взаимодействуют - их профили довольно похожи, тогда как нижняя часть явно рассинхронизирована.
В общем - баловаться можно долго, работает вроде не плохо.
Синие квадратики - присутствие указаных 10 белков в различных организмах. Поскольку в данном примере профили очень похожи, то вероятность их взаимодействия выходит высокой - что и требовалось узнать.
Другой, более сложный вариант - под катом:
Тут анализ показывает, что только три первых белка из списка (красный маркер) возможно взаимодействуют - их профили довольно похожи, тогда как нижняя часть явно рассинхронизирована.
В общем - баловаться можно долго, работает вроде не плохо.
