Опять про коннектом
Jan. 9th, 2011 10:23 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
imbgПомните наш пост про коннектом (ссылка).
Тогда в дискуссии![[livejournal.com profile]](https://www.dreamwidth.org/img/external/lj-userinfo.gif)
xplozive дал ссылку на модель нейронов червя C. elegant, сделаную русскими учеными. И вот я увидел репортаж Вестей.ру именно про эту компьютерную модель. Интересно, рекомендую:
Все-таки создание компьютерных моделей животных прогрессирует. Я уже мечтаю, когда виварии останутся в прошлом, и я буду ставить опыты на компьютерных тамагочи, которые не кусаются и обеспечить кушаньями которых не будет стоить целого состояния.
Но к сожалению, я занимаюсь метаболомом и сигнальными цепями - а это добро моделировать мы можем пока очень слабо. Для примера, картинка из статьи по системной биологии (обзорная статья профессора Холоденко, ведущего специалиста по системной биологии, который сейчас работает в University College Dublin):
Это упрощенная схема одного из сигнальных путей в абстрактной клетке (EGF receptor - Ras). А таких путей сотни, и они тесно переплетены в один жгут - зайдите в комнату с серверами большой организации - спутанные кабели вокруг дадут вам приблизительное представление. Плюс в каждой ткани (ну например в коже, в печени, в сердце или в мозге) есть свои особенности и дополнительные элементы.
Заинтересовавшихся отправляю к последнему обзору Бориса Холоденко "Signalling ballet in space and time".
Тогда в дискуссии
xplozive дал ссылку на модель нейронов червя C. elegant, сделаную русскими учеными. И вот я увидел репортаж Вестей.ру именно про эту компьютерную модель. Интересно, рекомендую:Все-таки создание компьютерных моделей животных прогрессирует. Я уже мечтаю, когда виварии останутся в прошлом, и я буду ставить опыты на компьютерных тамагочи, которые не кусаются и обеспечить кушаньями которых не будет стоить целого состояния.
Но к сожалению, я занимаюсь метаболомом и сигнальными цепями - а это добро моделировать мы можем пока очень слабо. Для примера, картинка из статьи по системной биологии (обзорная статья профессора Холоденко, ведущего специалиста по системной биологии, который сейчас работает в University College Dublin):
Это упрощенная схема одного из сигнальных путей в абстрактной клетке (EGF receptor - Ras). А таких путей сотни, и они тесно переплетены в один жгут - зайдите в комнату с серверами большой организации - спутанные кабели вокруг дадут вам приблизительное представление. Плюс в каждой ткани (ну например в коже, в печени, в сердце или в мозге) есть свои особенности и дополнительные элементы.
Заинтересовавшихся отправляю к последнему обзору Бориса Холоденко "Signalling ballet in space and time".
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2011-01-10 10:16 am (UTC)no subject
Date: 2011-01-10 02:31 pm (UTC)no subject
Date: 2011-01-10 06:13 pm (UTC)no subject
Date: 2011-01-10 06:44 pm (UTC)no subject
Date: 2011-01-10 07:17 pm (UTC)no subject
Date: 2011-01-10 07:23 pm (UTC)Офф
Date: 2011-01-10 07:38 pm (UTC)Делались такие опыты? Кто-нибудь знает?
Углекислого газа будет,наверное, больше растворятся в воде и почве. Питание растения будет лучше.
Re: Офф
Date: 2011-01-10 08:00 pm (UTC)А если увеличить давление в 10 раз, разве состав воздуха останеться прежним? Или количество молекул газов увеличится в 10 раз на тот же объем за счет давления?
Re: Офф
Date: 2011-01-10 08:12 pm (UTC)Re: Офф
Date: 2011-01-10 08:34 pm (UTC)Re: Офф
Date: 2011-01-10 09:40 pm (UTC)Re: Офф
Date: 2011-01-10 10:55 pm (UTC)no subject
Date: 2011-01-11 07:22 am (UTC)Это я к отсутствию моделей нервных сетей. ;-(
no subject
Date: 2011-01-11 06:09 pm (UTC)хм-хм
Date: 2011-01-11 08:23 pm (UTC)Re: хм-хм
Date: 2011-01-11 08:31 pm (UTC)no subject
Date: 2011-01-11 08:34 pm (UTC)no subject
Date: 2011-01-11 08:37 pm (UTC)no subject
Date: 2011-01-12 05:40 am (UTC)no subject
Date: 2011-01-12 05:46 am (UTC)Что же до репортажа. Фраза, например, "свет от лампочки причиняет ему страдания" меня, честно говоря, передергивает. Ну и много других "дырок". Кажется, эти "гордые журналисты" еще не доросли до мысли отдавать проект своего текста на правку хотя бы тому, о ком пишешь/снимаешь. ;-(
Re: хм-хм
Date: 2011-01-12 07:19 pm (UTC)просто странно ожидать от нейронной сети (математической) - полной имитации природной нейронной сети, здесь необходимы комбинированные и\или другие подходы
Re: хм-хм
Date: 2011-01-13 12:04 am (UTC)Минусы, конечно, тоже есть. Во-первых, все перечисленные модели моделируют кору, и я не знаю ни одной работы с моделями "внутренней рептилии" - чего конечно очень не хватает именно при имитации естественной нейронной сети (со всеми прикладными задачами кора справляется сама). Во-вторых, моделировать такие штуки на компьютерах (особенно всякие гибриды, типа как если взять и соединить все четыер вышеперечисленные вместе) пока даже сложнее, чем ядерные столкновения - не зря говорят, что мозг самая сложная штука во вселенной. Эти рассчёты плохо параллелятся (в отличие от ядерных столкновений и рассчётов белков), а посчитать последовательно даже сотню тысяч нейронов - задача неподъёмная для любого лабораторного кластера. Blue Brain, говорят, перемалывает 30 млн в масштабе времени 1:3, но модели там куда более простые...
В общем, надо ждать. Это всё ещё выстрелит.
Re: хм-хм
Date: 2011-01-13 11:03 am (UTC)Re: хм-хм
Date: 2011-01-13 04:15 pm (UTC)