Опять про коннектом

[imbg]

Помните наш пост про коннектом (ссылка).

Тогда в дискуссии xplozive дал ссылку на модель нейронов червя C. elegant, сделаную русскими учеными. И вот я увидел репортаж Вестей.ру именно про эту компьютерную модель. Интересно, рекомендую:

Все-таки создание компьютерных моделей животных прогрессирует. Я уже мечтаю, когда виварии останутся в прошлом, и я буду ставить опыты на компьютерных тамагочи, которые не кусаются и обеспечить кушаньями которых не будет стоить целого состояния. 

Но к сожалению, я занимаюсь метаболомом и сигнальными цепями - а это добро моделировать мы можем пока очень слабо. Для примера, картинка из статьи по системной биологии (обзорная статья профессора Холоденко, ведущего специалиста по системной биологии, который сейчас работает в University College Dublin):





Это упрощенная схема одного из сигнальных путей в абстрактной клетке (EGF receptor - Ras). А таких путей сотни, и они тесно переплетены в один жгут - зайдите в комнату с серверами большой организации - спутанные кабели вокруг дадут вам приблизительное представление. Плюс в каждой ткани (ну например в коже, в печени, в сердце или в мозге) есть свои особенности и дополнительные элементы.

Заинтересовавшихся отправляю к последнему обзору Бориса Холоденко  "Signalling ballet in space and time".

Comments

Re: Офф

[imbg.livejournal.com]

офф-оффа
А если увеличить давление в 10 раз, разве состав воздуха останеться прежним? Или количество молекул газов увеличится в 10 раз на тот же объем за счет давления?

Re: Офф

[sdfgj.livejournal.com]

Состав, конечно останется прежним. Количество молекул кислорода,азота,углекислого газа увеличится в 10 раз.

Re: Офф

[imbg.livejournal.com]

т.е. соотношение газов между собой останется прежним, но концентрации их увеличатся в 10 раз? Возьмем воду, в которой соотношение заварки и сахара 1:10, заварки 0,1 чайной ложки и сахара чайная ложка. И другую чашку, где заварки полная чайная ложка и 10 ложек сахара. Они по вкусу для вас будут различаться так же, как сжатый в 10 раз воздух для растений. ИМХО :)

Re: Офф

[sdfgj.livejournal.com]

И что говорит биологическая наука - в какой атмосфере (с 1 атм или 10 атм) будет больше дерево возраста 100 лет при оптимальном для этой атмосферы геноме?

Re: Офф

[imbg.livejournal.com]

Конечно, точный ответ вам дадут ботаники; но на мой взгляд при 10 атм дерево просто не выростет - так же как вы не будете пить супер-концентрированный чай :)