Рабочий вопрос

[imbg]

Мы готовим интервью для сайта Биомолекулы с девушкой пост-доком одного из Нобелевских лауреатов по медицине (кто именно - пока секрет). На какие бы вопросы вам интересно было бы получить ответы? вопросы можно писать в комментариях или слать мне на почту 

Comments

[xsanka.livejournal.com]

в какой хоть облатси эта девушка пост-док работала /или работает?

[imbg.livejournal.com]

Убиквитинирование белков. Молекулярные основы иммунной системы

[xsanka.livejournal.com]

ну самый очевидный вопрос - а как сложно попасть на постдоковскую позицию в лабу к Нобелевскому лауреату:-)?
так как молекулярные основы иммунной системы мне менее интересны, то про убиквитин - что известно о его участии в регуляции активности и репаративных ферментов/систем, ну например таких как АГТ (MGMT) возможно ли себе представить, что характер убиквитинирования этого белка имеет регуляторную функцию?
ну и просто для расширения мировозрения:-) -
на каких моделях изучат молекулярные основы имунной системы? Мыши ( нокаутные?), крысы? какие подходы используют? если только убиквитинирование белков то in vitro?

[imbg.livejournal.com]

первый вопрос учтен.
Второй вопрос - слишком личный ) - задайте ей лично через комментарии (когда интервью будет опубликовано, я дам ссылку в этом ЖЖ)
На третий же ответ дать могу я, поскольку работаю над тем же: основные инстьтрументы это сиРНК (худший вариант, потому что включает интерфероновую защиту, и это дает "фон"); нокаутные клеточные линии (или раковые клетки с интегрированными в геном shRNA, или фибробласты из нокаутных эмбрионов мышей: последние более адекватны, но трансфецировать их очень трудно - только вирусами - это большой минус); нокаутные мыши - это уже высший пилотаж, к тому же очень долго и дорого. Их получают в конце, когда известно что смотреть. В виде анектода - в этой статье (http://dx.doi.org/10.1038/nature09283) работа сделана на нокаутных мышах, полученных еще в 2001 году. Но долгое время не могли найти, что ж в них не так (потребовалось почти 10 лет).
Убиквитинирование изучают in vitro или при овер-экспрессии в клетках мутантных убиквитином (заменен Lys48Ala; Lys63Ala, все лизины заменены на аланины и т.п.). Последний подход позволяет определить вид убиквитинирования, участвующий в данном изучаемом процессе.