Транспортная информационная РНК
Feb. 26th, 2011 05:06 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
imbg Метаболизм живой клетки обеспечивается тысячами одновременно протекающих реакций. Поодиночке мы уже умеем их исследовать в пробирке. Также умеем активировать тот или иной сигнальный путь искусственно. Однако все эксперименты in vitro - это смешивание ферментов и субстратов в концентрациях, на несколько порядков превышающие их реальные количества в клетках.
Одно время это различие пытались объяснить с помощью белков-катализаторов - мол, они проводят намного более глубокий катализ по сравнению с КПД искусственной системы. Позже, с открытием сигнальных пептидов, начали учитывать компартментализацию белков - т.е. локальное повышение концентрации субстрата - в нужное время в нужном месте. Это уже более похоже на правду, учитывая что быстро были обнаружены и шапероны, и динамины, и еще многие транспортные белки.
То, что мРНК тоже может доставлять себя в нужный компартмент, было показано вначале на нервных клетках - чего зазря гонять белки по длиннющему аксону (например белки нейротрансмиттеров), если намного выгоднее в конец аксона отправить саму мРНК. Позже похожая роль мРНК в транспорте белков была показана для бета-актина и еще ряда белков. Суть просто - вместо того чтоб нарабатывать и транспортировать белок, энергетически выгоднее в правильны компартмент отправить саму мРНК, и там - на месте - уже белок и наработать.
Признаюсь, что до сегодняшнего дня я слышал о транспортировки мРНК только у эукариот (может, они были показаны ранее и для прокариот, но я не встречал). И вот сегодня на Биомолекуле.ру опубликована новость "Транспортная мРНК", где мы коротко описываем новые данные о роли мРНК в локализации белков у бактерий, и даем пяток разных ссылок на работы в этом направлении (на основе поседнего выпуска Science).
Читать целиком
Одно время это различие пытались объяснить с помощью белков-катализаторов - мол, они проводят намного более глубокий катализ по сравнению с КПД искусственной системы. Позже, с открытием сигнальных пептидов, начали учитывать компартментализацию белков - т.е. локальное повышение концентрации субстрата - в нужное время в нужном месте. Это уже более похоже на правду, учитывая что быстро были обнаружены и шапероны, и динамины, и еще многие транспортные белки.
То, что мРНК тоже может доставлять себя в нужный компартмент, было показано вначале на нервных клетках - чего зазря гонять белки по длиннющему аксону (например белки нейротрансмиттеров), если намного выгоднее в конец аксона отправить саму мРНК. Позже похожая роль мРНК в транспорте белков была показана для бета-актина и еще ряда белков. Суть просто - вместо того чтоб нарабатывать и транспортировать белок, энергетически выгоднее в правильны компартмент отправить саму мРНК, и там - на месте - уже белок и наработать.
Признаюсь, что до сегодняшнего дня я слышал о транспортировки мРНК только у эукариот (может, они были показаны ранее и для прокариот, но я не встречал). И вот сегодня на Биомолекуле.ру опубликована новость "Транспортная мРНК", где мы коротко описываем новые данные о роли мРНК в локализации белков у бактерий, и даем пяток разных ссылок на работы в этом направлении (на основе поседнего выпуска Science).
Читать целиком
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
Re: диффузия никак не может объяснить вектор реакций
Date: 2011-03-01 10:43 pm (UTC)Я вам предлагаю в качестве примера для размышления почитать часть 6 "Шагреневой кожи" моего руководителя - Кордюма, по ссылке:http://www.biopolymers.org.ua/archive/2005/06/B&C%20v21%20(2005)%20n485-514.pdf .Там есть как раз интересные расчеты - на основе скорости метаболизма, не транспорта мРНК - но все равно в ту же тему.
Re: почитать
Date: 2011-03-02 08:29 am (UTC)