imbg: (Default)
[personal profile] imbg
Известный журнал Nature снова лихорадит, хотя буквально неделю назад мы уже разбирали товарищеским судом это известное издание. 

И на этот раз под прицелом две статьи по исследованиям стволовых клеток за 2008 Шена Маяка (Shane Mayak), пост-дока профессорши Ами Вагерс (Amy Wagers). 

Причиной разбирательств послужило то, что в двух разных статьях -  Mayack et al. (Nature 463, 495–500; 2010)  и Mayack et al. (Blood 112, 519-531; 2008) два рисунка оказались идентичными. Разбирательство экспертами нашей странички выявило, что рисунки вполне нормальные, а главная причина всех придирок - отзыв публикации из Nature профессором, но не пост-доком.



Особо расстраивает тот факт, что сфабрикованными данными хотели доказать, что стареющие стволовые клетки крови под действием окружающей среду могут "молодеть"! Значит, опять чуда не получилось, и секрет вечной молоджости снова ускользнул от нас.

При отзыве статьи профессор Вагерс честно написала:  "a re-examination of the publication raised serious concerns with some of the reported data" (перепроверка данных выявила серьезные нестыковки с некоторыми опубликованными данными)  . При этом сам пост-док петицию не подписал, и до сих пор утверждает, что результаты были без обмана. - Nature News

А в чем обман?

Date: 2010-11-02 06:37 am (UTC)
From: [identity profile] v-s-c.livejournal.com
На первый взгляд оба рисунка действительно представляют одни и те же данные. Шкалы странноватые, но одинаковые. "Lineage-" и "Lin-", скорее всего, обозначают одно и то же. Так же, как и "c-kit" vs. "C-kit". ;-)

То есть проблема в публикации одних и тех же данных второй раз в Nature без ссылки на первую статью в Blood? Но это совсем не значит, что сами данные неверны. Или там было какая-то еще проблема?

Re: А в чем обман?

Date: 2010-11-02 04:38 pm (UTC)
From: [identity profile] imbg.livejournal.com
Главная проблема - это то, что трое из авторов (не включая пост-дока) написали отказ (http://www.nature.com/nature/journal/v467/n7317/pdf/nature09474.pdf).
Про картинки - они увы одинаковы. Подписи 5,1% и 5,08 - это разные числа, как бы похожи они не были. Т.е. картинки сознательно редактировали. А после этого уже никто особо не разбирался, и ответ был очень жестким - отзыв статей и анафема пост-докторанту.
From: [identity profile] v-s-c.livejournal.com
В общем, по не вполне ясным причинам соавторы решили отозвать рукопись. А заодно все возможные обвинения свалить на постдока. (Как будто они не читали рукопись перед отправкой!)

Вторичная публикация данных без ссылки на оригинал - нехорошо. Но, кажется, шум громче, чем имело смысл поднимать. И уж называть данные "сфабрикованными" только потому, что в первой статье они были указаны с точностью до десятых, а во второй - с точностью до сотых, я бы не стал. ;-)
From: [identity profile] imbg.livejournal.com
Ну, знаете, мы давно заметили, что Nature начинает заниматься "желтизной", чтоб привлечь читателей (Криминальное чтиво в Nature - http://imbg.livejournal.com/11725.html).
From: [identity profile] oude-rus.livejournal.com
Nature is NOT a scientific journal but a scientific magazine. И они действуют по совершенно другим принципам, чем любой журнал американского (к примеру) химического общества. Для них, как медийного журнала, главное - это жареное, а не наука.

Обвинять их в желтизне - ну все равно что жаловаться, что Известия пожелтели.
From: [identity profile] imbg.livejournal.com
Ну однако когда им это выгодно, они себя называют научным журналом, при чем "самым-самым"!

Nature 's 2009 Impact Factor is its highest ever (34.480). The journal remains the number one weekly science journal for the third consecutive year, and is the 8th highest ranked of 7347 journals by Impact Factor in the 2009 Journal Citation Report (JCR), Science Edition. Nature is also the most highly cited journal in the JCR, with 483,039 citations in 2009.
http://international.macmillan.com/MediaArticle.aspx?id=2262

Можно возразить, что тут речь идет о Nature Publishing Group, куда входит действительно солидные научные журналы. Но они в этом абзаце этого не указывают (дальше по тесту про NPG конечно говорят). По моему, на лицо маркетинговые ходы, которые им не очень пристало делать.

P.S. Хотя на самом деле, этот маркетинг работает очень эффективно - я не спорю :)
From: [identity profile] oude-rus.livejournal.com
ну давайте еще обсудим, что на сарае написано "х.й", а внутри - дрова. или наоборот, что случается чаще.
From: [identity profile] imbg.livejournal.com
обсудите конечно, но не со мной. Мне такое не интересно - наверное, не мой уровень.
Edited Date: 2010-11-02 10:32 pm (UTC)
From: [identity profile] oude-rus.livejournal.com
//Вторичная публикация данных без ссылки на оригинал - нехорошо.//

1. со ссылкой
2. это supplementary materials (а не сама статья), что допускается.

Re: А в чем обман?

Date: 2010-11-02 05:51 pm (UTC)
From: [identity profile] oude-rus.livejournal.com
Главная проблема совсем не в этом (вы как будто статью не читали). Проблема в том, что отозванная по каким-то своим причинам статья в Натуре содержала рисунок (в supplementary materials, что вполне допускается), идентичный 2-годовой давности публикации в Блад. И если эта статья отозвана, то вполне резонно задаться вопросом, не надо ли отозвать и статью в Блад. О чем и повествует процитированная реплика Кацнелсон в Натуре.

Ваши придирки к картинкам совершенно необоснованы (как вам уже многие заметили сверху и снизу). Данные весьма похожи, а 5.1 и 5.08 - это выводы, нанесенные поверх данных. Просто кто-то знающий эксперимент получше, обратил внимание аффтаров, что цифра 5.08% предполагает точность измерений в 0.01%, которая, скорее всего, там и рядом не стояла. После чего цифра была округлена. В чем проблема?

Не верите мне - обсудите это дело с вашими коллегами в Далласе, делов-то.

Re: А в чем обман?

Date: 2010-11-02 09:44 pm (UTC)
From: [identity profile] imbg.livejournal.com
Возможно вы правы. Я основывал эту новость на подписи к рисунку, которые вывесили на сайте Nature News. Привожу его без перевода:

Plots from two different experiments that seem to be nearly identical to one another are here presented together for comparison. The upper plot is from supplementary Figure S3b, associated with a recently retracted Nature paper by Mayack et al. (Nature 463, 495–500; 2010). The lower plot is part of Figure 6c from an earlier paper by Mayack and Wagers in the journal Blood (Blood 112, 519-531; 2008). The plots chart the frequency of blood stem cells in two different experimental situations, based on the detection of the sca-1 and c-kit markers.

Сейчас уже, прочитав обе статьи, - похоже что на обоих рисунках речь идет об одном и том же. Т.е. это не два разных эксперимента, о которых пишут в подписи на сайте, а один и тот же, дважды опубликованный. Хотя визуально видно, что он был доработан, но это уже не главное.

Re: А в чем обман?

Date: 2010-12-15 03:17 pm (UTC)
From: [identity profile] ioann-pupkin.livejournal.com
по-моему, это вы статью не читали:

The two plots in the Nature paper show flow cytometry data — a counting up of cells — after exposure to other cells in bone marrow taken from younger and older mice. They appear in Figure S3b in the supplementary material of the Nature paper. Two nearly identical plots showing cell counts after exposure to osteoblasts (bone cells) lacking a particular protein appear in Figure 6c of the Blood paper.

и в подписи к рисунку:

Plots from two different experiments that seem to be nearly identical to one another are here presented together for comparison.



Два разных эксперимента - а данные идентичны. Это fraud.

Re: А в чем обман?

Date: 2010-12-15 05:09 pm (UTC)
From: [identity profile] imbg.livejournal.com
Видите ли, мы сошлись в итоге на том, что Nature в подписи по невнимательности допустил ошибку, подписав так рисунок (Plots from two different experiments). Вы и я правильно прочитали заметку + подпись к рисунку: из текста новости следовало, что эти рисунки заявляли дважды независимо - fraud на лицо. Но когда мы полазили по самим статьям, оказалось что авторы включили один и тот же опыт в две статьи - в первом статья была в suppl. fig; во втором - вошла в тело. Nature не разобралась, и посчитала рисунки частью мошенничества. А, как я помню, вся заваруха произошла просто из-за того, что шеф поссорился с пост-доком - а остальное уже начли притягивать (двойная публикация рисунков без разрешения - это тоже fraud, только маленький :)

Re: А в чем обман?

Date: 2010-12-15 05:16 pm (UTC)
From: [identity profile] ioann-pupkin.livejournal.com
понял, спасибо за разъяснение

Profile

imbg: (Default)
Neo-IMBG

December 2020

S M T W T F S
  12345
6789101112
13 141516171819
20212223242526
2728293031  

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 31st, 2026 12:59 pm
Powered by Dreamwidth Studios